Protein–RNA interactions for Protein: Q02819

Nucb1, Nucleobindin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nucb1Q02819 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nucb1Q02819 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nucb1Q02819 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nucb1Q02819 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nucb1Q02819 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nucb1Q02819 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nucb1Q02819 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nucb1Q02819 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nucb1Q02819 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nucb1Q02819 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nucb1Q02819 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nucb1Q02819 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nucb1Q02819 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nucb1Q02819 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nucb1Q02819 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nucb1Q02819 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Nucb1Q02819 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Nucb1Q02819 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Nucb1Q02819 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Nucb1Q02819 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Nucb1Q02819 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Nucb1Q02819 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Nucb1Q02819 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Nucb1Q02819 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nucb1Q02819 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nucb1Q02819 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nucb1Q02819 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nucb1Q02819 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Nucb1Q02819 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nucb1Q02819 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Nucb1Q02819 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nucb1Q02819 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nucb1Q02819 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nucb1Q02819 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nucb1Q02819 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nucb1Q02819 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nucb1Q02819 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nucb1Q02819 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nucb1Q02819 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nucb1Q02819 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nucb1Q02819 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nucb1Q02819 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nucb1Q02819 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nucb1Q02819 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nucb1Q02819 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nucb1Q02819 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nucb1Q02819 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nucb1Q02819 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nucb1Q02819 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nucb1Q02819 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nucb1Q02819 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nucb1Q02819 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nucb1Q02819 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nucb1Q02819 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nucb1Q02819 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nucb1Q02819 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nucb1Q02819 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nucb1Q02819 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nucb1Q02819 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nucb1Q02819 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nucb1Q02819 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nucb1Q02819 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nucb1Q02819 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nucb1Q02819 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nucb1Q02819 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nucb1Q02819 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nucb1Q02819 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nucb1Q02819 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Nucb1Q02819 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nucb1Q02819 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nucb1Q02819 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nucb1Q02819 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nucb1Q02819 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nucb1Q02819 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nucb1Q02819 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nucb1Q02819 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nucb1Q02819 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nucb1Q02819 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nucb1Q02819 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nucb1Q02819 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nucb1Q02819 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nucb1Q02819 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nucb1Q02819 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nucb1Q02819 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nucb1Q02819 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nucb1Q02819 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nucb1Q02819 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nucb1Q02819 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nucb1Q02819 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nucb1Q02819 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nucb1Q02819 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nucb1Q02819 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nucb1Q02819 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nucb1Q02819 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nucb1Q02819 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nucb1Q02819 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nucb1Q02819 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Nucb1Q02819 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nucb1Q02819 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nucb1Q02819 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms