Protein–RNA interactions for Protein: Q02788

Col6a2, Collagen alpha-2(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,034 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a2Q02788 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col6a2Q02788 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col6a2Q02788 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col6a2Q02788 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col6a2Q02788 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col6a2Q02788 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col6a2Q02788 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col6a2Q02788 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col6a2Q02788 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col6a2Q02788 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col6a2Q02788 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col6a2Q02788 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col6a2Q02788 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col6a2Q02788 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col6a2Q02788 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col6a2Q02788 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col6a2Q02788 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col6a2Q02788 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col6a2Q02788 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col6a2Q02788 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col6a2Q02788 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col6a2Q02788 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Col6a2Q02788 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col6a2Q02788 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Col6a2Q02788 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col6a2Q02788 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col6a2Q02788 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Col6a2Q02788 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col6a2Q02788 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col6a2Q02788 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col6a2Q02788 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col6a2Q02788 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col6a2Q02788 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col6a2Q02788 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col6a2Q02788 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col6a2Q02788 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col6a2Q02788 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col6a2Q02788 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col6a2Q02788 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms