Protein–RNA interactions for Protein: Q02650

Pax5, Paired box protein Pax-5, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax5Q02650 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pax5Q02650 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pax5Q02650 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pax5Q02650 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Pax5Q02650 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pax5Q02650 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pax5Q02650 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pax5Q02650 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pax5Q02650 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pax5Q02650 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pax5Q02650 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pax5Q02650 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pax5Q02650 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pax5Q02650 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pax5Q02650 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pax5Q02650 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pax5Q02650 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pax5Q02650 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pax5Q02650 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pax5Q02650 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pax5Q02650 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pax5Q02650 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pax5Q02650 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pax5Q02650 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pax5Q02650 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pax5Q02650 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pax5Q02650 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pax5Q02650 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pax5Q02650 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pax5Q02650 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Pax5Q02650 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pax5Q02650 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pax5Q02650 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pax5Q02650 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pax5Q02650 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pax5Q02650 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pax5Q02650 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pax5Q02650 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pax5Q02650 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pax5Q02650 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pax5Q02650 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pax5Q02650 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pax5Q02650 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pax5Q02650 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pax5Q02650 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pax5Q02650 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pax5Q02650 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pax5Q02650 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pax5Q02650 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pax5Q02650 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pax5Q02650 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pax5Q02650 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pax5Q02650 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pax5Q02650 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pax5Q02650 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Pax5Q02650 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pax5Q02650 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pax5Q02650 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pax5Q02650 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Pax5Q02650 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pax5Q02650 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pax5Q02650 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pax5Q02650 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pax5Q02650 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pax5Q02650 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Pax5Q02650 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pax5Q02650 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pax5Q02650 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pax5Q02650 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pax5Q02650 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pax5Q02650 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Pax5Q02650 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pax5Q02650 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms