Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GscQ02591 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GscQ02591 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GscQ02591 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GscQ02591 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GscQ02591 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GscQ02591 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GscQ02591 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GscQ02591 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GscQ02591 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GscQ02591 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GscQ02591 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GscQ02591 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GscQ02591 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GscQ02591 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GscQ02591 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GscQ02591 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GscQ02591 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GscQ02591 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GscQ02591 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GscQ02591 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GscQ02591 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GscQ02591 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
GscQ02591 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
GscQ02591 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
GscQ02591 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
GscQ02591 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GscQ02591 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GscQ02591 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GscQ02591 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GscQ02591 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GscQ02591 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GscQ02591 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GscQ02591 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GscQ02591 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GscQ02591 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GscQ02591 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GscQ02591 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GscQ02591 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GscQ02591 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GscQ02591 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GscQ02591 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GscQ02591 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GscQ02591 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GscQ02591 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GscQ02591 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GscQ02591 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GscQ02591 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GscQ02591 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GscQ02591 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GscQ02591 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GscQ02591 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GscQ02591 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GscQ02591 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GscQ02591 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GscQ02591 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GscQ02591 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GscQ02591 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GscQ02591 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GscQ02591 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GscQ02591 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GscQ02591 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GscQ02591 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GscQ02591 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GscQ02591 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GscQ02591 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GscQ02591 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GscQ02591 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GscQ02591 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GscQ02591 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GscQ02591 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GscQ02591 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GscQ02591 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GscQ02591 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GscQ02591 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GscQ02591 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GscQ02591 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GscQ02591 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GscQ02591 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GscQ02591 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GscQ02591 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GscQ02591 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GscQ02591 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GscQ02591 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GscQ02591 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
GscQ02591 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
GscQ02591 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GscQ02591 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GscQ02591 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GscQ02591 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GscQ02591 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GscQ02591 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GscQ02591 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GscQ02591 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GscQ02591 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GscQ02591 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GscQ02591 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GscQ02591 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GscQ02591 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GscQ02591 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms