Protein–RNA interactions for Protein: Q02111

Prkcq, Protein kinase C theta type, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcqQ02111 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkcqQ02111 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkcqQ02111 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkcqQ02111 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkcqQ02111 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkcqQ02111 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkcqQ02111 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkcqQ02111 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkcqQ02111 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkcqQ02111 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkcqQ02111 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkcqQ02111 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkcqQ02111 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkcqQ02111 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkcqQ02111 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkcqQ02111 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkcqQ02111 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkcqQ02111 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkcqQ02111 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkcqQ02111 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkcqQ02111 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkcqQ02111 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkcqQ02111 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkcqQ02111 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkcqQ02111 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkcqQ02111 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkcqQ02111 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkcqQ02111 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkcqQ02111 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkcqQ02111 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkcqQ02111 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkcqQ02111 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkcqQ02111 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkcqQ02111 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkcqQ02111 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkcqQ02111 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkcqQ02111 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkcqQ02111 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkcqQ02111 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkcqQ02111 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkcqQ02111 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkcqQ02111 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkcqQ02111 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkcqQ02111 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkcqQ02111 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkcqQ02111 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkcqQ02111 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkcqQ02111 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkcqQ02111 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkcqQ02111 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkcqQ02111 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkcqQ02111 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkcqQ02111 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkcqQ02111 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkcqQ02111 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkcqQ02111 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkcqQ02111 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkcqQ02111 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkcqQ02111 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkcqQ02111 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkcqQ02111 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkcqQ02111 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkcqQ02111 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkcqQ02111 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkcqQ02111 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkcqQ02111 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkcqQ02111 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkcqQ02111 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkcqQ02111 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkcqQ02111 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkcqQ02111 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkcqQ02111 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkcqQ02111 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkcqQ02111 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PrkcqQ02111 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PrkcqQ02111 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PrkcqQ02111 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PrkcqQ02111 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PrkcqQ02111 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PrkcqQ02111 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PrkcqQ02111 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PrkcqQ02111 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PrkcqQ02111 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PrkcqQ02111 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PrkcqQ02111 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PrkcqQ02111 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PrkcqQ02111 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PrkcqQ02111 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PrkcqQ02111 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PrkcqQ02111 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PrkcqQ02111 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PrkcqQ02111 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PrkcqQ02111 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PrkcqQ02111 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PrkcqQ02111 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PrkcqQ02111 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PrkcqQ02111 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PrkcqQ02111 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PrkcqQ02111 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PrkcqQ02111 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms