Protein–RNA interactions for Protein: Q01098

Grin2c, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2cQ01098 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grin2cQ01098 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grin2cQ01098 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grin2cQ01098 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Grin2cQ01098 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grin2cQ01098 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grin2cQ01098 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Grin2cQ01098 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grin2cQ01098 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grin2cQ01098 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grin2cQ01098 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grin2cQ01098 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grin2cQ01098 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grin2cQ01098 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grin2cQ01098 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grin2cQ01098 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grin2cQ01098 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grin2cQ01098 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grin2cQ01098 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grin2cQ01098 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grin2cQ01098 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grin2cQ01098 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Grin2cQ01098 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Grin2cQ01098 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Grin2cQ01098 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Grin2cQ01098 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Grin2cQ01098 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Grin2cQ01098 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Grin2cQ01098 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Grin2cQ01098 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Grin2cQ01098 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Grin2cQ01098 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Grin2cQ01098 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Grin2cQ01098 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Grin2cQ01098 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Grin2cQ01098 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Grin2cQ01098 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Grin2cQ01098 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Grin2cQ01098 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Grin2cQ01098 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Grin2cQ01098 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Grin2cQ01098 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Grin2cQ01098 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Grin2cQ01098 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grin2cQ01098 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grin2cQ01098 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grin2cQ01098 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grin2cQ01098 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grin2cQ01098 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grin2cQ01098 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grin2cQ01098 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grin2cQ01098 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grin2cQ01098 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grin2cQ01098 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grin2cQ01098 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grin2cQ01098 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grin2cQ01098 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Grin2cQ01098 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grin2cQ01098 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Grin2cQ01098 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grin2cQ01098 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grin2cQ01098 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grin2cQ01098 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grin2cQ01098 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grin2cQ01098 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grin2cQ01098 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grin2cQ01098 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grin2cQ01098 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grin2cQ01098 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grin2cQ01098 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grin2cQ01098 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grin2cQ01098 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grin2cQ01098 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grin2cQ01098 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grin2cQ01098 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Grin2cQ01098 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grin2cQ01098 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grin2cQ01098 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grin2cQ01098 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grin2cQ01098 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grin2cQ01098 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grin2cQ01098 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grin2cQ01098 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grin2cQ01098 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grin2cQ01098 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grin2cQ01098 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grin2cQ01098 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grin2cQ01098 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grin2cQ01098 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grin2cQ01098 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Grin2cQ01098 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grin2cQ01098 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grin2cQ01098 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grin2cQ01098 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Grin2cQ01098 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grin2cQ01098 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grin2cQ01098 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Grin2cQ01098 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Grin2cQ01098 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Grin2cQ01098 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms