Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.08□□□□□ -0.63
PrcdQ00LT2 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms