Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itga4Q00651 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itga4Q00651 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itga4Q00651 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itga4Q00651 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itga4Q00651 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itga4Q00651 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itga4Q00651 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itga4Q00651 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itga4Q00651 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itga4Q00651 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itga4Q00651 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Itga4Q00651 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Itga4Q00651 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itga4Q00651 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itga4Q00651 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Itga4Q00651 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Itga4Q00651 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itga4Q00651 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itga4Q00651 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itga4Q00651 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itga4Q00651 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itga4Q00651 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Itga4Q00651 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga4Q00651 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga4Q00651 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga4Q00651 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga4Q00651 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga4Q00651 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga4Q00651 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga4Q00651 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga4Q00651 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga4Q00651 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga4Q00651 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga4Q00651 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga4Q00651 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms