Protein–RNA interactions for Protein: Q00420

Gabpb1, GA-binding protein subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb1Q00420 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gabpb1Q00420 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gabpb1Q00420 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gabpb1Q00420 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gabpb1Q00420 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gabpb1Q00420 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gabpb1Q00420 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gabpb1Q00420 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gabpb1Q00420 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gabpb1Q00420 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gabpb1Q00420 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gabpb1Q00420 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gabpb1Q00420 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gabpb1Q00420 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gabpb1Q00420 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gabpb1Q00420 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gabpb1Q00420 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gabpb1Q00420 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gabpb1Q00420 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gabpb1Q00420 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gabpb1Q00420 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gabpb1Q00420 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gabpb1Q00420 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gabpb1Q00420 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gabpb1Q00420 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gabpb1Q00420 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gabpb1Q00420 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gabpb1Q00420 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gabpb1Q00420 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabpb1Q00420 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabpb1Q00420 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabpb1Q00420 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabpb1Q00420 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabpb1Q00420 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabpb1Q00420 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabpb1Q00420 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabpb1Q00420 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabpb1Q00420 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabpb1Q00420 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabpb1Q00420 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabpb1Q00420 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabpb1Q00420 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabpb1Q00420 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabpb1Q00420 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabpb1Q00420 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabpb1Q00420 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabpb1Q00420 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabpb1Q00420 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabpb1Q00420 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabpb1Q00420 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabpb1Q00420 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabpb1Q00420 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabpb1Q00420 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabpb1Q00420 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabpb1Q00420 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabpb1Q00420 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabpb1Q00420 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gabpb1Q00420 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gabpb1Q00420 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gabpb1Q00420 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gabpb1Q00420 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gabpb1Q00420 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gabpb1Q00420 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gabpb1Q00420 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gabpb1Q00420 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gabpb1Q00420 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gabpb1Q00420 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gabpb1Q00420 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gabpb1Q00420 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gabpb1Q00420 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gabpb1Q00420 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gabpb1Q00420 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gabpb1Q00420 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gabpb1Q00420 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gabpb1Q00420 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms