Protein–RNA interactions for Protein: P97460

Npas2, Neuronal PAS domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 816 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas2P97460 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Npas2P97460 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Npas2P97460 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Npas2P97460 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Npas2P97460 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Npas2P97460 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Npas2P97460 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Npas2P97460 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Npas2P97460 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Npas2P97460 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Npas2P97460 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Npas2P97460 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Npas2P97460 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Npas2P97460 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Npas2P97460 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Npas2P97460 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Npas2P97460 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Npas2P97460 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Npas2P97460 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Npas2P97460 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Npas2P97460 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Npas2P97460 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Npas2P97460 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Npas2P97460 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Npas2P97460 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Npas2P97460 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Npas2P97460 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Npas2P97460 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Npas2P97460 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Npas2P97460 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Npas2P97460 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Npas2P97460 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Npas2P97460 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Npas2P97460 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Npas2P97460 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Npas2P97460 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Npas2P97460 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Npas2P97460 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Npas2P97460 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Npas2P97460 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Npas2P97460 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Npas2P97460 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Npas2P97460 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Npas2P97460 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Npas2P97460 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Npas2P97460 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Npas2P97460 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Npas2P97460 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Npas2P97460 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Npas2P97460 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Npas2P97460 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Npas2P97460 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Npas2P97460 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Npas2P97460 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Npas2P97460 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Npas2P97460 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Npas2P97460 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Npas2P97460 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Npas2P97460 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Npas2P97460 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Npas2P97460 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Npas2P97460 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Npas2P97460 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Npas2P97460 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Npas2P97460 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Npas2P97460 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Npas2P97460 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Npas2P97460 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Npas2P97460 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Npas2P97460 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Npas2P97460 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Npas2P97460 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Npas2P97460 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Npas2P97460 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Npas2P97460 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Npas2P97460 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Npas2P97460 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Npas2P97460 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Npas2P97460 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Npas2P97460 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Npas2P97460 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Npas2P97460 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Npas2P97460 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Npas2P97460 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Npas2P97460 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Npas2P97460 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Npas2P97460 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Npas2P97460 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Npas2P97460 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Npas2P97460 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Npas2P97460 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Npas2P97460 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Npas2P97460 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Npas2P97460 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Npas2P97460 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Npas2P97460 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Npas2P97460 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Npas2P97460 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Npas2P97460 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Npas2P97460 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms