Protein–RNA interactions for Protein: P97443

Smyd1, Histone-lysine N-methyltransferase Smyd1, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smyd1P97443 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smyd1P97443 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smyd1P97443 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smyd1P97443 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smyd1P97443 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smyd1P97443 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smyd1P97443 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smyd1P97443 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smyd1P97443 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smyd1P97443 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smyd1P97443 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smyd1P97443 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smyd1P97443 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Smyd1P97443 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Smyd1P97443 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Smyd1P97443 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Smyd1P97443 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Smyd1P97443 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Smyd1P97443 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Smyd1P97443 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Smyd1P97443 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Smyd1P97443 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Smyd1P97443 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Smyd1P97443 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Smyd1P97443 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smyd1P97443 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smyd1P97443 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smyd1P97443 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smyd1P97443 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smyd1P97443 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smyd1P97443 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smyd1P97443 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smyd1P97443 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smyd1P97443 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smyd1P97443 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smyd1P97443 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smyd1P97443 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smyd1P97443 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smyd1P97443 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smyd1P97443 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smyd1P97443 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smyd1P97443 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smyd1P97443 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smyd1P97443 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smyd1P97443 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smyd1P97443 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smyd1P97443 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smyd1P97443 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smyd1P97443 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smyd1P97443 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smyd1P97443 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Smyd1P97443 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smyd1P97443 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Smyd1P97443 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Smyd1P97443 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Smyd1P97443 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smyd1P97443 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smyd1P97443 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smyd1P97443 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smyd1P97443 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smyd1P97443 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smyd1P97443 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smyd1P97443 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smyd1P97443 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smyd1P97443 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smyd1P97443 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smyd1P97443 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Smyd1P97443 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Smyd1P97443 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smyd1P97443 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smyd1P97443 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smyd1P97443 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smyd1P97443 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smyd1P97443 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smyd1P97443 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smyd1P97443 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smyd1P97443 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smyd1P97443 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smyd1P97443 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Smyd1P97443 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smyd1P97443 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smyd1P97443 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Smyd1P97443 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smyd1P97443 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smyd1P97443 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smyd1P97443 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smyd1P97443 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smyd1P97443 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smyd1P97443 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smyd1P97443 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smyd1P97443 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smyd1P97443 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smyd1P97443 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smyd1P97443 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smyd1P97443 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smyd1P97443 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smyd1P97443 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smyd1P97443 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smyd1P97443 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smyd1P97443 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms