Protein–RNA interactions for Protein: P86793

Ccl21c, C-C motif chemokine 21c, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl21cP86793 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccl21cP86793 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccl21cP86793 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccl21cP86793 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccl21cP86793 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccl21cP86793 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccl21cP86793 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccl21cP86793 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccl21cP86793 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccl21cP86793 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccl21cP86793 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccl21cP86793 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccl21cP86793 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccl21cP86793 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccl21cP86793 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Ccl21cP86793 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Ccl21cP86793 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccl21cP86793 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccl21cP86793 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Ccl21cP86793 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccl21cP86793 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccl21cP86793 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccl21cP86793 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccl21cP86793 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccl21cP86793 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Ccl21cP86793 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccl21cP86793 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccl21cP86793 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccl21cP86793 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccl21cP86793 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccl21cP86793 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccl21cP86793 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccl21cP86793 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccl21cP86793 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Ccl21cP86793 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccl21cP86793 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Ccl21cP86793 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccl21cP86793 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Ccl21cP86793 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Ccl21cP86793 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccl21cP86793 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccl21cP86793 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccl21cP86793 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Ccl21cP86793 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccl21cP86793 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Ccl21cP86793 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Ccl21cP86793 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccl21cP86793 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccl21cP86793 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccl21cP86793 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccl21cP86793 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccl21cP86793 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ccl21cP86793 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ccl21cP86793 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ccl21cP86793 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ccl21cP86793 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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Ccl21cP86793 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ccl21cP86793 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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Ccl21cP86793 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ccl21cP86793 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ccl21cP86793 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ccl21cP86793 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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