Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
H3f3aP84244 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
H3f3aP84244 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
H3f3aP84244 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
H3f3aP84244 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
H3f3aP84244 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
H3f3aP84244 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
H3f3aP84244 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
H3f3aP84244 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
H3f3aP84244 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
H3f3aP84244 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
H3f3aP84244 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
H3f3aP84244 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
H3f3aP84244 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
H3f3aP84244 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
H3f3aP84244 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
H3f3aP84244 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
H3f3aP84244 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
H3f3aP84244 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
H3f3aP84244 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
H3f3aP84244 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
H3f3aP84244 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
H3f3aP84244 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
H3f3aP84244 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
H3f3aP84244 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
H3f3aP84244 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
H3f3aP84244 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
H3f3aP84244 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
H3f3aP84244 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
H3f3aP84244 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
H3f3aP84244 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
H3f3aP84244 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
H3f3aP84244 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
H3f3aP84244 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
H3f3aP84244 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
H3f3aP84244 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
H3f3aP84244 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
H3f3aP84244 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
H3f3aP84244 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
H3f3aP84244 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
H3f3aP84244 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
H3f3aP84244 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
H3f3aP84244 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
H3f3aP84244 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
H3f3aP84244 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
H3f3aP84244 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
H3f3aP84244 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
H3f3aP84244 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
H3f3aP84244 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
H3f3aP84244 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
H3f3aP84244 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
H3f3aP84244 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
H3f3aP84244 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
H3f3aP84244 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
H3f3aP84244 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
H3f3aP84244 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
H3f3aP84244 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
H3f3aP84244 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
H3f3aP84244 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
H3f3aP84244 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
H3f3aP84244 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
H3f3aP84244 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
H3f3aP84244 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
H3f3aP84244 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
H3f3aP84244 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
H3f3aP84244 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
H3f3aP84244 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
H3f3aP84244 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
H3f3aP84244 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
H3f3aP84244 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
H3f3aP84244 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
H3f3aP84244 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
H3f3aP84244 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
H3f3aP84244 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
H3f3aP84244 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
H3f3aP84244 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
H3f3aP84244 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
H3f3aP84244 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
H3f3aP84244 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
H3f3aP84244 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
H3f3aP84244 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
H3f3aP84244 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
H3f3aP84244 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
H3f3aP84244 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
H3f3aP84244 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
H3f3aP84244 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
H3f3aP84244 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
H3f3aP84244 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
H3f3aP84244 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
H3f3aP84244 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
H3f3aP84244 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
H3f3aP84244 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
H3f3aP84244 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
H3f3aP84244 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
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