Protein–RNA interactions for Protein: P82976

Gbx1, Homeobox protein GBX-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx1P82976 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gbx1P82976 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gbx1P82976 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gbx1P82976 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gbx1P82976 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gbx1P82976 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gbx1P82976 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gbx1P82976 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gbx1P82976 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gbx1P82976 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gbx1P82976 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gbx1P82976 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gbx1P82976 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gbx1P82976 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gbx1P82976 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gbx1P82976 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms