Protein–RNA interactions for Protein: P70698

Ctps1, CTP synthase 1, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctps1P70698 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctps1P70698 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctps1P70698 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctps1P70698 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctps1P70698 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctps1P70698 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctps1P70698 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctps1P70698 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctps1P70698 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctps1P70698 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctps1P70698 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctps1P70698 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctps1P70698 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctps1P70698 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctps1P70698 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctps1P70698 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctps1P70698 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctps1P70698 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctps1P70698 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctps1P70698 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctps1P70698 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctps1P70698 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctps1P70698 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctps1P70698 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctps1P70698 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctps1P70698 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctps1P70698 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctps1P70698 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctps1P70698 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctps1P70698 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctps1P70698 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctps1P70698 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctps1P70698 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctps1P70698 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctps1P70698 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctps1P70698 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctps1P70698 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctps1P70698 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctps1P70698 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctps1P70698 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctps1P70698 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctps1P70698 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctps1P70698 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctps1P70698 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctps1P70698 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctps1P70698 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctps1P70698 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctps1P70698 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctps1P70698 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctps1P70698 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ctps1P70698 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ctps1P70698 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ctps1P70698 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ctps1P70698 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ctps1P70698 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctps1P70698 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctps1P70698 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctps1P70698 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctps1P70698 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctps1P70698 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctps1P70698 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctps1P70698 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctps1P70698 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctps1P70698 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctps1P70698 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctps1P70698 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctps1P70698 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctps1P70698 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctps1P70698 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctps1P70698 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctps1P70698 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctps1P70698 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctps1P70698 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctps1P70698 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctps1P70698 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctps1P70698 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctps1P70698 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctps1P70698 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctps1P70698 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctps1P70698 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctps1P70698 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctps1P70698 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctps1P70698 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctps1P70698 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctps1P70698 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctps1P70698 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctps1P70698 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctps1P70698 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctps1P70698 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctps1P70698 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctps1P70698 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctps1P70698 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctps1P70698 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctps1P70698 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctps1P70698 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctps1P70698 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctps1P70698 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctps1P70698 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctps1P70698 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctps1P70698 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms