Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp9xP70398 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
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