Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxd13P70217 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxd13P70217 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxd13P70217 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxd13P70217 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxd13P70217 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxd13P70217 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxd13P70217 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxd13P70217 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxd13P70217 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxd13P70217 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxd13P70217 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxd13P70217 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxd13P70217 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxd13P70217 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxd13P70217 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxd13P70217 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxd13P70217 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxd13P70217 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxd13P70217 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxd13P70217 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxd13P70217 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxd13P70217 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxd13P70217 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxd13P70217 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxd13P70217 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxd13P70217 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxd13P70217 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxd13P70217 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxd13P70217 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxd13P70217 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxd13P70217 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxd13P70217 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxd13P70217 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxd13P70217 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxd13P70217 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxd13P70217 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxd13P70217 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxd13P70217 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxd13P70217 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxd13P70217 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxd13P70217 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxd13P70217 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxd13P70217 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxd13P70217 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxd13P70217 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxd13P70217 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxd13P70217 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxd13P70217 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxd13P70217 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxd13P70217 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxd13P70217 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxd13P70217 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxd13P70217 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxd13P70217 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxd13P70217 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxd13P70217 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxd13P70217 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxd13P70217 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxd13P70217 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxd13P70217 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxd13P70217 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxd13P70217 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxd13P70217 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxd13P70217 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxd13P70217 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxd13P70217 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxd13P70217 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxd13P70217 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxd13P70217 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxd13P70217 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxd13P70217 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxd13P70217 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxd13P70217 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxd13P70217 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxd13P70217 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxd13P70217 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxd13P70217 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxd13P70217 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxd13P70217 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxd13P70217 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxd13P70217 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxd13P70217 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxd13P70217 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxd13P70217 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxd13P70217 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxd13P70217 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxd13P70217 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxd13P70217 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxd13P70217 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxd13P70217 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxd13P70217 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxd13P70217 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxd13P70217 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxd13P70217 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxd13P70217 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxd13P70217 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxd13P70217 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxd13P70217 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxd13P70217 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms