Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SbdsP70122 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SbdsP70122 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SbdsP70122 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SbdsP70122 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SbdsP70122 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SbdsP70122 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SbdsP70122 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SbdsP70122 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SbdsP70122 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SbdsP70122 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SbdsP70122 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SbdsP70122 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SbdsP70122 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SbdsP70122 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SbdsP70122 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SbdsP70122 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SbdsP70122 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SbdsP70122 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SbdsP70122 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SbdsP70122 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SbdsP70122 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SbdsP70122 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SbdsP70122 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SbdsP70122 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SbdsP70122 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SbdsP70122 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SbdsP70122 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SbdsP70122 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SbdsP70122 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SbdsP70122 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SbdsP70122 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SbdsP70122 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SbdsP70122 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SbdsP70122 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SbdsP70122 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SbdsP70122 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SbdsP70122 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SbdsP70122 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SbdsP70122 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SbdsP70122 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SbdsP70122 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SbdsP70122 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SbdsP70122 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SbdsP70122 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SbdsP70122 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SbdsP70122 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SbdsP70122 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SbdsP70122 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SbdsP70122 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SbdsP70122 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SbdsP70122 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SbdsP70122 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SbdsP70122 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SbdsP70122 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SbdsP70122 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SbdsP70122 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SbdsP70122 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SbdsP70122 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SbdsP70122 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SbdsP70122 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SbdsP70122 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SbdsP70122 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SbdsP70122 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SbdsP70122 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SbdsP70122 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SbdsP70122 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SbdsP70122 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SbdsP70122 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SbdsP70122 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SbdsP70122 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SbdsP70122 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SbdsP70122 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SbdsP70122 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SbdsP70122 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SbdsP70122 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SbdsP70122 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SbdsP70122 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SbdsP70122 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SbdsP70122 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SbdsP70122 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SbdsP70122 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SbdsP70122 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SbdsP70122 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SbdsP70122 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SbdsP70122 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SbdsP70122 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SbdsP70122 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SbdsP70122 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SbdsP70122 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SbdsP70122 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SbdsP70122 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SbdsP70122 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SbdsP70122 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SbdsP70122 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SbdsP70122 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SbdsP70122 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SbdsP70122 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SbdsP70122 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SbdsP70122 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.7 ms