Protein–RNA interactions for Protein: P63080

Gabrb3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrb3P63080 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabrb3P63080 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabrb3P63080 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabrb3P63080 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabrb3P63080 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabrb3P63080 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabrb3P63080 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabrb3P63080 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabrb3P63080 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabrb3P63080 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabrb3P63080 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabrb3P63080 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabrb3P63080 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabrb3P63080 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabrb3P63080 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabrb3P63080 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabrb3P63080 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabrb3P63080 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabrb3P63080 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabrb3P63080 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabrb3P63080 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabrb3P63080 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabrb3P63080 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabrb3P63080 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabrb3P63080 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabrb3P63080 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabrb3P63080 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabrb3P63080 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabrb3P63080 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabrb3P63080 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabrb3P63080 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabrb3P63080 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabrb3P63080 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabrb3P63080 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabrb3P63080 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabrb3P63080 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabrb3P63080 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabrb3P63080 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabrb3P63080 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabrb3P63080 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabrb3P63080 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabrb3P63080 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabrb3P63080 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabrb3P63080 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabrb3P63080 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabrb3P63080 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabrb3P63080 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabrb3P63080 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabrb3P63080 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabrb3P63080 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabrb3P63080 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabrb3P63080 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabrb3P63080 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabrb3P63080 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabrb3P63080 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabrb3P63080 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabrb3P63080 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabrb3P63080 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabrb3P63080 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabrb3P63080 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabrb3P63080 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabrb3P63080 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabrb3P63080 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabrb3P63080 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabrb3P63080 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabrb3P63080 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabrb3P63080 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabrb3P63080 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabrb3P63080 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabrb3P63080 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabrb3P63080 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabrb3P63080 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabrb3P63080 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabrb3P63080 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabrb3P63080 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabrb3P63080 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabrb3P63080 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabrb3P63080 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabrb3P63080 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabrb3P63080 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabrb3P63080 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabrb3P63080 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabrb3P63080 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabrb3P63080 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabrb3P63080 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabrb3P63080 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabrb3P63080 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabrb3P63080 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabrb3P63080 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabrb3P63080 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabrb3P63080 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabrb3P63080 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabrb3P63080 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gabrb3P63080 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms