Protein–RNA interactions for Protein: P61219

Polr2f, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2fP61219 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Polr2fP61219 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Polr2fP61219 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Polr2fP61219 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Polr2fP61219 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Polr2fP61219 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Polr2fP61219 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Polr2fP61219 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Polr2fP61219 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Polr2fP61219 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Polr2fP61219 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Polr2fP61219 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Polr2fP61219 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Polr2fP61219 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Polr2fP61219 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Polr2fP61219 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Polr2fP61219 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Polr2fP61219 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Polr2fP61219 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Polr2fP61219 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Polr2fP61219 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Polr2fP61219 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Polr2fP61219 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Polr2fP61219 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Polr2fP61219 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Polr2fP61219 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Polr2fP61219 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Polr2fP61219 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Polr2fP61219 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Polr2fP61219 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Polr2fP61219 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Polr2fP61219 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Polr2fP61219 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Polr2fP61219 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Polr2fP61219 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Polr2fP61219 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Polr2fP61219 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Polr2fP61219 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Polr2fP61219 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Polr2fP61219 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Polr2fP61219 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Polr2fP61219 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Polr2fP61219 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Polr2fP61219 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Polr2fP61219 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Polr2fP61219 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Polr2fP61219 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Polr2fP61219 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Polr2fP61219 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Polr2fP61219 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Polr2fP61219 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Polr2fP61219 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Polr2fP61219 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Polr2fP61219 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Polr2fP61219 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Polr2fP61219 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Polr2fP61219 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Polr2fP61219 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Polr2fP61219 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Polr2fP61219 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Polr2fP61219 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Polr2fP61219 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Polr2fP61219 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Polr2fP61219 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Polr2fP61219 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Polr2fP61219 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Polr2fP61219 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Polr2fP61219 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Polr2fP61219 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Polr2fP61219 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Polr2fP61219 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Polr2fP61219 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Polr2fP61219 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Polr2fP61219 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Polr2fP61219 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Polr2fP61219 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Polr2fP61219 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Polr2fP61219 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Polr2fP61219 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Polr2fP61219 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Polr2fP61219 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Polr2fP61219 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Polr2fP61219 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Polr2fP61219 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Polr2fP61219 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Polr2fP61219 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Polr2fP61219 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Polr2fP61219 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Polr2fP61219 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Polr2fP61219 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Polr2fP61219 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Polr2fP61219 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Polr2fP61219 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Polr2fP61219 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Polr2fP61219 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Polr2fP61219 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Polr2fP61219 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Polr2fP61219 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Polr2fP61219 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Polr2fP61219 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms