Protein–RNA interactions for Protein: P61164

Actr1a, Alpha-centractin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actr1aP61164 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Actr1aP61164 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Actr1aP61164 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Actr1aP61164 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Actr1aP61164 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Actr1aP61164 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Actr1aP61164 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Actr1aP61164 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Actr1aP61164 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Actr1aP61164 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms