Protein–RNA interactions for Protein: P61082

Ube2m, NEDD8-conjugating enzyme Ubc12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2mP61082 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2mP61082 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2mP61082 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2mP61082 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2mP61082 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2mP61082 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2mP61082 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2mP61082 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2mP61082 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2mP61082 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2mP61082 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2mP61082 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2mP61082 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2mP61082 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2mP61082 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2mP61082 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2mP61082 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2mP61082 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2mP61082 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2mP61082 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2mP61082 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2mP61082 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2mP61082 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2mP61082 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2mP61082 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2mP61082 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2mP61082 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2mP61082 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2mP61082 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2mP61082 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2mP61082 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2mP61082 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2mP61082 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2mP61082 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2mP61082 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2mP61082 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2mP61082 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2mP61082 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2mP61082 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2mP61082 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2mP61082 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2mP61082 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2mP61082 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2mP61082 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2mP61082 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2mP61082 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2mP61082 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2mP61082 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2mP61082 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2mP61082 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2mP61082 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2mP61082 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2mP61082 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2mP61082 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2mP61082 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2mP61082 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2mP61082 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2mP61082 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2mP61082 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2mP61082 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2mP61082 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2mP61082 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2mP61082 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2mP61082 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2mP61082 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2mP61082 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2mP61082 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2mP61082 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2mP61082 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2mP61082 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2mP61082 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2mP61082 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2mP61082 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2mP61082 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2mP61082 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2mP61082 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2mP61082 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2mP61082 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2mP61082 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2mP61082 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube2mP61082 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube2mP61082 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube2mP61082 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube2mP61082 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube2mP61082 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube2mP61082 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube2mP61082 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube2mP61082 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube2mP61082 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube2mP61082 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube2mP61082 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube2mP61082 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube2mP61082 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube2mP61082 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube2mP61082 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube2mP61082 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube2mP61082 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube2mP61082 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube2mP61082 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube2mP61082 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms