Protein–RNA interactions for Protein: P61080

Ube2d1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d1P61080 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ube2d1P61080 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms