Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ppfia3P60469 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ppfia3P60469 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ppfia3P60469 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ppfia3P60469 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ppfia3P60469 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ppfia3P60469 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ppfia3P60469 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ppfia3P60469 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ppfia3P60469 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ppfia3P60469 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ppfia3P60469 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ppfia3P60469 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ppfia3P60469 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ppfia3P60469 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ppfia3P60469 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ppfia3P60469 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ppfia3P60469 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ppfia3P60469 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ppfia3P60469 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ppfia3P60469 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ppfia3P60469 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ppfia3P60469 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ppfia3P60469 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ppfia3P60469 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ppfia3P60469 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ppfia3P60469 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ppfia3P60469 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ppfia3P60469 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ppfia3P60469 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ppfia3P60469 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ppfia3P60469 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ppfia3P60469 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ppfia3P60469 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ppfia3P60469 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ppfia3P60469 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ppfia3P60469 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ppfia3P60469 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ppfia3P60469 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ppfia3P60469 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ppfia3P60469 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ppfia3P60469 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ppfia3P60469 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ppfia3P60469 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ppfia3P60469 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ppfia3P60469 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ppfia3P60469 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ppfia3P60469 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ppfia3P60469 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ppfia3P60469 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ppfia3P60469 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ppfia3P60469 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ppfia3P60469 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ppfia3P60469 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ppfia3P60469 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ppfia3P60469 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ppfia3P60469 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ppfia3P60469 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ppfia3P60469 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ppfia3P60469 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ppfia3P60469 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ppfia3P60469 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ppfia3P60469 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ppfia3P60469 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ppfia3P60469 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ppfia3P60469 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ppfia3P60469 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ppfia3P60469 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ppfia3P60469 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ppfia3P60469 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ppfia3P60469 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ppfia3P60469 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ppfia3P60469 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ppfia3P60469 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ppfia3P60469 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ppfia3P60469 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ppfia3P60469 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ppfia3P60469 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ppfia3P60469 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ppfia3P60469 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ppfia3P60469 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ppfia3P60469 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ppfia3P60469 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ppfia3P60469 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ppfia3P60469 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ppfia3P60469 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ppfia3P60469 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ppfia3P60469 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ppfia3P60469 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ppfia3P60469 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ppfia3P60469 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ppfia3P60469 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ppfia3P60469 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ppfia3P60469 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ppfia3P60469 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ppfia3P60469 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ppfia3P60469 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ppfia3P60469 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ppfia3P60469 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ppfia3P60469 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms