Protein–RNA interactions for Protein: P58774

Tpm2, Tropomyosin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm2P58774 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tpm2P58774 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tpm2P58774 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tpm2P58774 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tpm2P58774 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tpm2P58774 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tpm2P58774 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tpm2P58774 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tpm2P58774 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tpm2P58774 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tpm2P58774 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tpm2P58774 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tpm2P58774 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tpm2P58774 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tpm2P58774 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tpm2P58774 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tpm2P58774 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tpm2P58774 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tpm2P58774 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tpm2P58774 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tpm2P58774 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tpm2P58774 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tpm2P58774 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tpm2P58774 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tpm2P58774 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tpm2P58774 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tpm2P58774 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tpm2P58774 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tpm2P58774 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tpm2P58774 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tpm2P58774 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tpm2P58774 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tpm2P58774 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tpm2P58774 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tpm2P58774 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tpm2P58774 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tpm2P58774 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tpm2P58774 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tpm2P58774 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tpm2P58774 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tpm2P58774 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tpm2P58774 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tpm2P58774 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tpm2P58774 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tpm2P58774 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tpm2P58774 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tpm2P58774 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tpm2P58774 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Tpm2P58774 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tpm2P58774 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tpm2P58774 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tpm2P58774 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tpm2P58774 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tpm2P58774 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tpm2P58774 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tpm2P58774 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tpm2P58774 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tpm2P58774 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tpm2P58774 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tpm2P58774 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tpm2P58774 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tpm2P58774 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tpm2P58774 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tpm2P58774 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tpm2P58774 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tpm2P58774 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tpm2P58774 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tpm2P58774 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tpm2P58774 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Tpm2P58774 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tpm2P58774 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tpm2P58774 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tpm2P58774 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Tpm2P58774 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tpm2P58774 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tpm2P58774 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Tpm2P58774 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tpm2P58774 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tpm2P58774 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tpm2P58774 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tpm2P58774 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Tpm2P58774 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tpm2P58774 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tpm2P58774 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tpm2P58774 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tpm2P58774 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tpm2P58774 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tpm2P58774 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tpm2P58774 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Tpm2P58774 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tpm2P58774 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tpm2P58774 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tpm2P58774 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tpm2P58774 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tpm2P58774 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tpm2P58774 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tpm2P58774 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tpm2P58774 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tpm2P58774 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tpm2P58774 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms