Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp25P57080 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp25P57080 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp25P57080 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp25P57080 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp25P57080 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp25P57080 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp25P57080 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp25P57080 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp25P57080 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp25P57080 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp25P57080 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp25P57080 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp25P57080 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp25P57080 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp25P57080 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp25P57080 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp25P57080 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp25P57080 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp25P57080 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp25P57080 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp25P57080 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp25P57080 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp25P57080 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp25P57080 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp25P57080 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp25P57080 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp25P57080 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp25P57080 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp25P57080 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp25P57080 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp25P57080 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp25P57080 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp25P57080 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp25P57080 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp25P57080 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp25P57080 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp25P57080 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp25P57080 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp25P57080 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp25P57080 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp25P57080 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp25P57080 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp25P57080 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp25P57080 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp25P57080 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp25P57080 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp25P57080 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp25P57080 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp25P57080 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp25P57080 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp25P57080 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp25P57080 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp25P57080 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp25P57080 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp25P57080 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp25P57080 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp25P57080 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp25P57080 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp25P57080 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp25P57080 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp25P57080 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp25P57080 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp25P57080 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp25P57080 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp25P57080 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp25P57080 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp25P57080 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp25P57080 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp25P57080 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp25P57080 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp25P57080 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp25P57080 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp25P57080 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp25P57080 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp25P57080 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp25P57080 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp25P57080 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp25P57080 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp25P57080 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp25P57080 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp25P57080 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp25P57080 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp25P57080 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp25P57080 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp25P57080 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp25P57080 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp25P57080 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp25P57080 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp25P57080 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp25P57080 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp25P57080 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp25P57080 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp25P57080 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp25P57080 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp25P57080 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp25P57080 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp25P57080 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp25P57080 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp25P57080 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms