Protein–RNA interactions for Protein: P56916

Gsc2, Homeobox protein goosecoid-2, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsc2P56916 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gsc2P56916 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gsc2P56916 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gsc2P56916 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gsc2P56916 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gsc2P56916 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Gsc2P56916 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gsc2P56916 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Gsc2P56916 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gsc2P56916 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gsc2P56916 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gsc2P56916 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gsc2P56916 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gsc2P56916 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gsc2P56916 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gsc2P56916 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gsc2P56916 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gsc2P56916 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gsc2P56916 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gsc2P56916 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gsc2P56916 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gsc2P56916 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gsc2P56916 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gsc2P56916 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gsc2P56916 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gsc2P56916 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gsc2P56916 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gsc2P56916 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gsc2P56916 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gsc2P56916 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gsc2P56916 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gsc2P56916 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gsc2P56916 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gsc2P56916 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gsc2P56916 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gsc2P56916 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gsc2P56916 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gsc2P56916 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gsc2P56916 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gsc2P56916 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gsc2P56916 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gsc2P56916 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gsc2P56916 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gsc2P56916 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gsc2P56916 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gsc2P56916 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gsc2P56916 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gsc2P56916 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gsc2P56916 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gsc2P56916 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gsc2P56916 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gsc2P56916 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gsc2P56916 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gsc2P56916 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gsc2P56916 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gsc2P56916 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gsc2P56916 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gsc2P56916 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gsc2P56916 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gsc2P56916 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gsc2P56916 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gsc2P56916 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gsc2P56916 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gsc2P56916 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gsc2P56916 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gsc2P56916 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Gsc2P56916 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gsc2P56916 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Gsc2P56916 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gsc2P56916 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Gsc2P56916 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gsc2P56916 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gsc2P56916 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gsc2P56916 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gsc2P56916 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gsc2P56916 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gsc2P56916 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Gsc2P56916 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gsc2P56916 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gsc2P56916 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Gsc2P56916 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gsc2P56916 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gsc2P56916 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gsc2P56916 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gsc2P56916 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gsc2P56916 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gsc2P56916 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gsc2P56916 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gsc2P56916 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gsc2P56916 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gsc2P56916 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gsc2P56916 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gsc2P56916 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gsc2P56916 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gsc2P56916 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gsc2P56916 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gsc2P56916 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gsc2P56916 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gsc2P56916 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gsc2P56916 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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