Protein–RNA interactions for Protein: P56818

Bace1, Beta-secretase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace1P56818 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Bace1P56818 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Bace1P56818 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Bace1P56818 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Bace1P56818 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Bace1P56818 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Bace1P56818 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Bace1P56818 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Bace1P56818 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Bace1P56818 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Bace1P56818 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Bace1P56818 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Bace1P56818 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Bace1P56818 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Bace1P56818 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Bace1P56818 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Bace1P56818 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Bace1P56818 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Bace1P56818 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Bace1P56818 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Bace1P56818 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Bace1P56818 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Bace1P56818 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Bace1P56818 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Bace1P56818 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Bace1P56818 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Bace1P56818 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Bace1P56818 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Bace1P56818 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Bace1P56818 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Bace1P56818 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Bace1P56818 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Bace1P56818 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Bace1P56818 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Bace1P56818 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Bace1P56818 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Bace1P56818 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Bace1P56818 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Bace1P56818 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Bace1P56818 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Bace1P56818 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Bace1P56818 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Bace1P56818 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Bace1P56818 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Bace1P56818 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Bace1P56818 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Bace1P56818 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Bace1P56818 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Bace1P56818 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Bace1P56818 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Bace1P56818 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Bace1P56818 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Bace1P56818 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Bace1P56818 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Bace1P56818 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Bace1P56818 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Bace1P56818 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Bace1P56818 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Bace1P56818 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Bace1P56818 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Bace1P56818 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Bace1P56818 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Bace1P56818 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Bace1P56818 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Bace1P56818 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Bace1P56818 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Bace1P56818 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Bace1P56818 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Bace1P56818 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Bace1P56818 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Bace1P56818 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Bace1P56818 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Bace1P56818 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Bace1P56818 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Bace1P56818 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Bace1P56818 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Bace1P56818 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Bace1P56818 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Bace1P56818 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Bace1P56818 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Bace1P56818 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Bace1P56818 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Bace1P56818 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Bace1P56818 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Bace1P56818 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Bace1P56818 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Bace1P56818 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Bace1P56818 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Bace1P56818 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Bace1P56818 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Bace1P56818 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Bace1P56818 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Bace1P56818 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Bace1P56818 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Bace1P56818 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Bace1P56818 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Bace1P56818 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Bace1P56818 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Bace1P56818 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Bace1P56818 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms