Protein–RNA interactions for Protein: P56726

Smo, Smoothened homolog, mousemouse

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Length 793 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmoP56726 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SmoP56726 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SmoP56726 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SmoP56726 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SmoP56726 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SmoP56726 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SmoP56726 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SmoP56726 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SmoP56726 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SmoP56726 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SmoP56726 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SmoP56726 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SmoP56726 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SmoP56726 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SmoP56726 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SmoP56726 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SmoP56726 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SmoP56726 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SmoP56726 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SmoP56726 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SmoP56726 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SmoP56726 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SmoP56726 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SmoP56726 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SmoP56726 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SmoP56726 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SmoP56726 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SmoP56726 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SmoP56726 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SmoP56726 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SmoP56726 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SmoP56726 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SmoP56726 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SmoP56726 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SmoP56726 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SmoP56726 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SmoP56726 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SmoP56726 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SmoP56726 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SmoP56726 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SmoP56726 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SmoP56726 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SmoP56726 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SmoP56726 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SmoP56726 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SmoP56726 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SmoP56726 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SmoP56726 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SmoP56726 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SmoP56726 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SmoP56726 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SmoP56726 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SmoP56726 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SmoP56726 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SmoP56726 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SmoP56726 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SmoP56726 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SmoP56726 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SmoP56726 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SmoP56726 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SmoP56726 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SmoP56726 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SmoP56726 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SmoP56726 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SmoP56726 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SmoP56726 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SmoP56726 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SmoP56726 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SmoP56726 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SmoP56726 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SmoP56726 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SmoP56726 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SmoP56726 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SmoP56726 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SmoP56726 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SmoP56726 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SmoP56726 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SmoP56726 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SmoP56726 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SmoP56726 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SmoP56726 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SmoP56726 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SmoP56726 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SmoP56726 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SmoP56726 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SmoP56726 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SmoP56726 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SmoP56726 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SmoP56726 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SmoP56726 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SmoP56726 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SmoP56726 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SmoP56726 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SmoP56726 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SmoP56726 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SmoP56726 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SmoP56726 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SmoP56726 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SmoP56726 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SmoP56726 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
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