Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Usp5P56399 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Usp5P56399 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Usp5P56399 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Usp5P56399 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp5P56399 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp5P56399 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp5P56399 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp5P56399 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp5P56399 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp5P56399 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp5P56399 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp5P56399 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp5P56399 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp5P56399 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp5P56399 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp5P56399 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp5P56399 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp5P56399 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp5P56399 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp5P56399 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp5P56399 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp5P56399 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp5P56399 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp5P56399 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp5P56399 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp5P56399 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp5P56399 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp5P56399 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp5P56399 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp5P56399 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp5P56399 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp5P56399 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp5P56399 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp5P56399 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp5P56399 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp5P56399 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp5P56399 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp5P56399 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp5P56399 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp5P56399 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp5P56399 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp5P56399 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp5P56399 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp5P56399 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp5P56399 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp5P56399 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp5P56399 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp5P56399 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp5P56399 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp5P56399 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp5P56399 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp5P56399 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp5P56399 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp5P56399 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp5P56399 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp5P56399 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp5P56399 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp5P56399 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp5P56399 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp5P56399 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp5P56399 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp5P56399 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp5P56399 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp5P56399 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp5P56399 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp5P56399 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp5P56399 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp5P56399 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp5P56399 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp5P56399 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp5P56399 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp5P56399 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp5P56399 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp5P56399 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp5P56399 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp5P56399 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp5P56399 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp5P56399 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp5P56399 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp5P56399 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp5P56399 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp5P56399 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp5P56399 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp5P56399 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp5P56399 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp5P56399 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp5P56399 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp5P56399 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp5P56399 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp5P56399 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp5P56399 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp5P56399 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp5P56399 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp5P56399 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp5P56399 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp5P56399 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp5P56399 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp5P56399 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp5P56399 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms