Protein–RNA interactions for Protein: P56382

Atp5e, ATP synthase subunit epsilon, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5eP56382 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Atp5eP56382 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atp5eP56382 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atp5eP56382 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atp5eP56382 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atp5eP56382 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atp5eP56382 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atp5eP56382 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atp5eP56382 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atp5eP56382 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atp5eP56382 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atp5eP56382 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atp5eP56382 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atp5eP56382 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atp5eP56382 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atp5eP56382 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atp5eP56382 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atp5eP56382 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atp5eP56382 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atp5eP56382 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atp5eP56382 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atp5eP56382 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atp5eP56382 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atp5eP56382 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atp5eP56382 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atp5eP56382 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atp5eP56382 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atp5eP56382 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atp5eP56382 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atp5eP56382 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atp5eP56382 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atp5eP56382 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atp5eP56382 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atp5eP56382 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atp5eP56382 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atp5eP56382 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atp5eP56382 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Atp5eP56382 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atp5eP56382 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atp5eP56382 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atp5eP56382 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atp5eP56382 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atp5eP56382 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atp5eP56382 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atp5eP56382 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atp5eP56382 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atp5eP56382 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atp5eP56382 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atp5eP56382 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Atp5eP56382 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atp5eP56382 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atp5eP56382 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atp5eP56382 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atp5eP56382 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atp5eP56382 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atp5eP56382 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atp5eP56382 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atp5eP56382 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atp5eP56382 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atp5eP56382 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atp5eP56382 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atp5eP56382 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atp5eP56382 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atp5eP56382 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atp5eP56382 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Atp5eP56382 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Atp5eP56382 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Atp5eP56382 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Atp5eP56382 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Atp5eP56382 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Atp5eP56382 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Atp5eP56382 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Atp5eP56382 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Atp5eP56382 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Atp5eP56382 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Atp5eP56382 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Atp5eP56382 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Atp5eP56382 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Atp5eP56382 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Atp5eP56382 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Atp5eP56382 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Atp5eP56382 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Atp5eP56382 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Atp5eP56382 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Atp5eP56382 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Atp5eP56382 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Atp5eP56382 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Atp5eP56382 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Atp5eP56382 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Atp5eP56382 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Atp5eP56382 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Atp5eP56382 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Atp5eP56382 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Atp5eP56382 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Atp5eP56382 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Atp5eP56382 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Atp5eP56382 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Atp5eP56382 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Atp5eP56382 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Atp5eP56382 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms