Protein–RNA interactions for Protein: P56213

Gfer, FAD-linked sulfhydryl oxidase ALR, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GferP56213 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
GferP56213 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
GferP56213 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
GferP56213 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
GferP56213 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
GferP56213 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
GferP56213 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
GferP56213 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
GferP56213 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
GferP56213 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
GferP56213 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
GferP56213 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
GferP56213 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
GferP56213 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
GferP56213 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
GferP56213 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
GferP56213 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
GferP56213 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
GferP56213 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
GferP56213 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
GferP56213 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
GferP56213 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
GferP56213 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
GferP56213 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
GferP56213 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
GferP56213 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
GferP56213 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
GferP56213 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
GferP56213 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
GferP56213 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
GferP56213 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
GferP56213 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
GferP56213 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
GferP56213 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
GferP56213 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
GferP56213 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
GferP56213 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
GferP56213 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
GferP56213 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
GferP56213 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
GferP56213 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
GferP56213 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
GferP56213 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
GferP56213 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
GferP56213 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
GferP56213 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
GferP56213 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
GferP56213 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
GferP56213 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
GferP56213 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
GferP56213 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
GferP56213 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
GferP56213 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
GferP56213 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
GferP56213 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
GferP56213 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
GferP56213 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
GferP56213 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
GferP56213 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
GferP56213 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
GferP56213 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
GferP56213 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
GferP56213 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
GferP56213 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
GferP56213 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
GferP56213 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
GferP56213 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
GferP56213 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
GferP56213 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
GferP56213 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
GferP56213 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
GferP56213 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GferP56213 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GferP56213 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC13□□□□□ -0.33
GferP56213 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GferP56213 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GferP56213 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GferP56213 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
GferP56213 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
GferP56213 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GferP56213 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
GferP56213 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GferP56213 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
GferP56213 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GferP56213 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
GferP56213 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GferP56213 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GferP56213 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GferP56213 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
GferP56213 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
GferP56213 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GferP56213 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GferP56213 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GferP56213 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GferP56213 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
GferP56213 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
GferP56213 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
GferP56213 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GferP56213 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
GferP56213 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms