Protein–RNA interactions for Protein: P56183

Rrp1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1P56183 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rrp1P56183 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rrp1P56183 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rrp1P56183 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rrp1P56183 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rrp1P56183 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rrp1P56183 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rrp1P56183 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rrp1P56183 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rrp1P56183 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rrp1P56183 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rrp1P56183 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rrp1P56183 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rrp1P56183 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rrp1P56183 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rrp1P56183 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rrp1P56183 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rrp1P56183 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Rrp1P56183 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rrp1P56183 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rrp1P56183 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rrp1P56183 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rrp1P56183 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rrp1P56183 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rrp1P56183 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rrp1P56183 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rrp1P56183 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Rrp1P56183 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rrp1P56183 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rrp1P56183 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rrp1P56183 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rrp1P56183 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rrp1P56183 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rrp1P56183 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rrp1P56183 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rrp1P56183 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rrp1P56183 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rrp1P56183 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rrp1P56183 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rrp1P56183 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rrp1P56183 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rrp1P56183 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rrp1P56183 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rrp1P56183 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rrp1P56183 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rrp1P56183 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rrp1P56183 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rrp1P56183 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rrp1P56183 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Rrp1P56183 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rrp1P56183 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Rrp1P56183 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rrp1P56183 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rrp1P56183 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rrp1P56183 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rrp1P56183 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rrp1P56183 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rrp1P56183 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rrp1P56183 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Rrp1P56183 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rrp1P56183 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rrp1P56183 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rrp1P56183 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rrp1P56183 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rrp1P56183 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rrp1P56183 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rrp1P56183 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rrp1P56183 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rrp1P56183 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rrp1P56183 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rrp1P56183 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rrp1P56183 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rrp1P56183 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rrp1P56183 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rrp1P56183 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rrp1P56183 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rrp1P56183 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Rrp1P56183 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Rrp1P56183 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rrp1P56183 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rrp1P56183 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Rrp1P56183 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Rrp1P56183 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Rrp1P56183 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Rrp1P56183 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Rrp1P56183 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rrp1P56183 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rrp1P56183 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rrp1P56183 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rrp1P56183 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rrp1P56183 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rrp1P56183 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rrp1P56183 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rrp1P56183 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rrp1P56183 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rrp1P56183 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rrp1P56183 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rrp1P56183 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rrp1P56183 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rrp1P56183 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms