Protein–RNA interactions for Protein: P55014

Slc12a1, Solute carrier family 12 member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,095 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc12a1P55014 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc12a1P55014 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc12a1P55014 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc12a1P55014 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc12a1P55014 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc12a1P55014 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc12a1P55014 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc12a1P55014 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc12a1P55014 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc12a1P55014 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc12a1P55014 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc12a1P55014 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc12a1P55014 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc12a1P55014 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc12a1P55014 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc12a1P55014 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc12a1P55014 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc12a1P55014 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc12a1P55014 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc12a1P55014 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc12a1P55014 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc12a1P55014 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc12a1P55014 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc12a1P55014 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc12a1P55014 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc12a1P55014 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc12a1P55014 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc12a1P55014 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc12a1P55014 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc12a1P55014 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc12a1P55014 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc12a1P55014 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc12a1P55014 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc12a1P55014 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc12a1P55014 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc12a1P55014 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc12a1P55014 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc12a1P55014 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc12a1P55014 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc12a1P55014 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc12a1P55014 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc12a1P55014 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc12a1P55014 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc12a1P55014 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc12a1P55014 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc12a1P55014 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc12a1P55014 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc12a1P55014 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc12a1P55014 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc12a1P55014 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc12a1P55014 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc12a1P55014 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc12a1P55014 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc12a1P55014 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc12a1P55014 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc12a1P55014 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc12a1P55014 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc12a1P55014 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc12a1P55014 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc12a1P55014 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc12a1P55014 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc12a1P55014 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc12a1P55014 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc12a1P55014 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc12a1P55014 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc12a1P55014 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc12a1P55014 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc12a1P55014 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc12a1P55014 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc12a1P55014 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc12a1P55014 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc12a1P55014 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc12a1P55014 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc12a1P55014 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc12a1P55014 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc12a1P55014 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc12a1P55014 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc12a1P55014 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc12a1P55014 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc12a1P55014 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc12a1P55014 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc12a1P55014 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc12a1P55014 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc12a1P55014 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc12a1P55014 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc12a1P55014 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc12a1P55014 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc12a1P55014 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc12a1P55014 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc12a1P55014 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc12a1P55014 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc12a1P55014 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc12a1P55014 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc12a1P55014 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc12a1P55014 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc12a1P55014 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc12a1P55014 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc12a1P55014 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc12a1P55014 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc12a1P55014 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms