Protein–RNA interactions for Protein: P54726

Rad23a, UV excision repair protein RAD23 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23aP54726 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rad23aP54726 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rad23aP54726 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rad23aP54726 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rad23aP54726 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rad23aP54726 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rad23aP54726 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rad23aP54726 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rad23aP54726 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rad23aP54726 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rad23aP54726 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rad23aP54726 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rad23aP54726 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rad23aP54726 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rad23aP54726 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rad23aP54726 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rad23aP54726 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rad23aP54726 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rad23aP54726 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rad23aP54726 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rad23aP54726 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rad23aP54726 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rad23aP54726 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rad23aP54726 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rad23aP54726 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rad23aP54726 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rad23aP54726 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rad23aP54726 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rad23aP54726 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rad23aP54726 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rad23aP54726 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rad23aP54726 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rad23aP54726 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Rad23aP54726 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rad23aP54726 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rad23aP54726 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rad23aP54726 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rad23aP54726 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rad23aP54726 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rad23aP54726 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rad23aP54726 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rad23aP54726 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rad23aP54726 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rad23aP54726 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rad23aP54726 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rad23aP54726 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rad23aP54726 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rad23aP54726 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rad23aP54726 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rad23aP54726 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rad23aP54726 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rad23aP54726 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rad23aP54726 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rad23aP54726 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rad23aP54726 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rad23aP54726 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rad23aP54726 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rad23aP54726 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rad23aP54726 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rad23aP54726 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rad23aP54726 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rad23aP54726 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rad23aP54726 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rad23aP54726 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rad23aP54726 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rad23aP54726 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rad23aP54726 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rad23aP54726 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rad23aP54726 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Rad23aP54726 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Rad23aP54726 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Rad23aP54726 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Rad23aP54726 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rad23aP54726 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rad23aP54726 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rad23aP54726 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rad23aP54726 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rad23aP54726 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rad23aP54726 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rad23aP54726 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rad23aP54726 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rad23aP54726 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rad23aP54726 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rad23aP54726 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rad23aP54726 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rad23aP54726 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rad23aP54726 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rad23aP54726 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rad23aP54726 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rad23aP54726 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rad23aP54726 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rad23aP54726 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rad23aP54726 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rad23aP54726 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rad23aP54726 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rad23aP54726 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rad23aP54726 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rad23aP54726 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rad23aP54726 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rad23aP54726 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms