Protein–RNA interactions for Protein: P54254

Atxn1, Ataxin-1, mousemouse

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn1P54254 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atxn1P54254 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atxn1P54254 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atxn1P54254 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atxn1P54254 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atxn1P54254 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atxn1P54254 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atxn1P54254 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atxn1P54254 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atxn1P54254 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atxn1P54254 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Atxn1P54254 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atxn1P54254 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atxn1P54254 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atxn1P54254 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atxn1P54254 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atxn1P54254 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atxn1P54254 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atxn1P54254 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atxn1P54254 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atxn1P54254 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atxn1P54254 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atxn1P54254 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atxn1P54254 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atxn1P54254 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atxn1P54254 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atxn1P54254 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atxn1P54254 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atxn1P54254 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atxn1P54254 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atxn1P54254 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atxn1P54254 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atxn1P54254 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atxn1P54254 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atxn1P54254 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atxn1P54254 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atxn1P54254 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atxn1P54254 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atxn1P54254 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Atxn1P54254 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atxn1P54254 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Atxn1P54254 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atxn1P54254 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atxn1P54254 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atxn1P54254 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atxn1P54254 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atxn1P54254 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atxn1P54254 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atxn1P54254 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atxn1P54254 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atxn1P54254 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atxn1P54254 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atxn1P54254 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atxn1P54254 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atxn1P54254 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atxn1P54254 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atxn1P54254 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atxn1P54254 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atxn1P54254 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atxn1P54254 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atxn1P54254 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atxn1P54254 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atxn1P54254 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atxn1P54254 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Atxn1P54254 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atxn1P54254 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atxn1P54254 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atxn1P54254 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atxn1P54254 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atxn1P54254 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Atxn1P54254 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atxn1P54254 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atxn1P54254 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atxn1P54254 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atxn1P54254 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atxn1P54254 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atxn1P54254 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atxn1P54254 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atxn1P54254 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atxn1P54254 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atxn1P54254 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atxn1P54254 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atxn1P54254 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atxn1P54254 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atxn1P54254 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atxn1P54254 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atxn1P54254 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atxn1P54254 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atxn1P54254 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atxn1P54254 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atxn1P54254 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atxn1P54254 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atxn1P54254 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atxn1P54254 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atxn1P54254 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atxn1P54254 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atxn1P54254 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atxn1P54254 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atxn1P54254 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atxn1P54254 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms