Protein–RNA interactions for Protein: P53564

Cux1, Homeobox protein cut-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux1P53564 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
Cux1P53564 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
Cux1P53564 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Cux1P53564 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Cux1P53564 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cux1P53564 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cux1P53564 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cux1P53564 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cux1P53564 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cux1P53564 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cux1P53564 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cux1P53564 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cux1P53564 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cux1P53564 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Cux1P53564 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Cux1P53564 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cux1P53564 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cux1P53564 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cux1P53564 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cux1P53564 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cux1P53564 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cux1P53564 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cux1P53564 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cux1P53564 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Cux1P53564 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cux1P53564 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cux1P53564 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cux1P53564 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cux1P53564 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cux1P53564 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cux1P53564 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cux1P53564 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cux1P53564 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cux1P53564 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cux1P53564 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cux1P53564 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cux1P53564 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cux1P53564 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cux1P53564 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cux1P53564 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cux1P53564 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cux1P53564 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cux1P53564 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cux1P53564 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cux1P53564 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cux1P53564 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cux1P53564 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cux1P53564 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cux1P53564 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cux1P53564 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Cux1P53564 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cux1P53564 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cux1P53564 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Cux1P53564 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cux1P53564 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cux1P53564 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cux1P53564 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cux1P53564 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cux1P53564 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cux1P53564 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Cux1P53564 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cux1P53564 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Cux1P53564 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cux1P53564 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cux1P53564 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cux1P53564 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cux1P53564 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cux1P53564 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cux1P53564 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cux1P53564 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cux1P53564 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cux1P53564 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Cux1P53564 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cux1P53564 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cux1P53564 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cux1P53564 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cux1P53564 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cux1P53564 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cux1P53564 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cux1P53564 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cux1P53564 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cux1P53564 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cux1P53564 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cux1P53564 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cux1P53564 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Cux1P53564 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cux1P53564 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cux1P53564 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cux1P53564 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cux1P53564 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cux1P53564 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cux1P53564 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cux1P53564 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cux1P53564 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cux1P53564 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cux1P53564 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cux1P53564 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cux1P53564 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cux1P53564 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cux1P53564 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms