Protein–RNA interactions for Protein: P53349

Map3k1, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map3k1P53349 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Map3k1P53349 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Map3k1P53349 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Map3k1P53349 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Map3k1P53349 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Map3k1P53349 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Map3k1P53349 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Map3k1P53349 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Map3k1P53349 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Map3k1P53349 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Map3k1P53349 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Map3k1P53349 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Map3k1P53349 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Map3k1P53349 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Map3k1P53349 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Map3k1P53349 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Map3k1P53349 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Map3k1P53349 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Map3k1P53349 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Map3k1P53349 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Map3k1P53349 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Map3k1P53349 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Map3k1P53349 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Map3k1P53349 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Map3k1P53349 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Map3k1P53349 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Map3k1P53349 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Map3k1P53349 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Map3k1P53349 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Map3k1P53349 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Map3k1P53349 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Map3k1P53349 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Map3k1P53349 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Map3k1P53349 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Map3k1P53349 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Map3k1P53349 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Map3k1P53349 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Map3k1P53349 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Map3k1P53349 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Map3k1P53349 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Map3k1P53349 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Map3k1P53349 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Map3k1P53349 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
Map3k1P53349 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Map3k1P53349 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Map3k1P53349 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Map3k1P53349 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
Map3k1P53349 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
Map3k1P53349 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Map3k1P53349 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Map3k1P53349 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Map3k1P53349 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Map3k1P53349 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Map3k1P53349 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Map3k1P53349 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Map3k1P53349 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Map3k1P53349 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Map3k1P53349 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Map3k1P53349 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Map3k1P53349 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Map3k1P53349 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Map3k1P53349 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Map3k1P53349 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Map3k1P53349 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Map3k1P53349 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Map3k1P53349 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Map3k1P53349 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Map3k1P53349 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Map3k1P53349 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Map3k1P53349 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Map3k1P53349 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Map3k1P53349 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Map3k1P53349 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Map3k1P53349 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Map3k1P53349 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Map3k1P53349 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Map3k1P53349 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Map3k1P53349 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Map3k1P53349 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Map3k1P53349 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Map3k1P53349 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Map3k1P53349 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Map3k1P53349 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Map3k1P53349 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Map3k1P53349 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Map3k1P53349 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Map3k1P53349 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Map3k1P53349 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Map3k1P53349 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Map3k1P53349 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Map3k1P53349 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Map3k1P53349 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Map3k1P53349 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Map3k1P53349 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Map3k1P53349 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Map3k1P53349 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Map3k1P53349 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Map3k1P53349 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Map3k1P53349 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Map3k1P53349 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms