Protein–RNA interactions for Protein: P52432

Polr1c, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1cP52432 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Polr1cP52432 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Polr1cP52432 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Polr1cP52432 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Polr1cP52432 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Polr1cP52432 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Polr1cP52432 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Polr1cP52432 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Polr1cP52432 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Polr1cP52432 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Polr1cP52432 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Polr1cP52432 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Polr1cP52432 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Polr1cP52432 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Polr1cP52432 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Polr1cP52432 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Polr1cP52432 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Polr1cP52432 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Polr1cP52432 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Polr1cP52432 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Polr1cP52432 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Polr1cP52432 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Polr1cP52432 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Polr1cP52432 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Polr1cP52432 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Polr1cP52432 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Polr1cP52432 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Polr1cP52432 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Polr1cP52432 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Polr1cP52432 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Polr1cP52432 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Polr1cP52432 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Polr1cP52432 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Polr1cP52432 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Polr1cP52432 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Polr1cP52432 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Polr1cP52432 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Polr1cP52432 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Polr1cP52432 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Polr1cP52432 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Polr1cP52432 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Polr1cP52432 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Polr1cP52432 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Polr1cP52432 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Polr1cP52432 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Polr1cP52432 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Polr1cP52432 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Polr1cP52432 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Polr1cP52432 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Polr1cP52432 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Polr1cP52432 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Polr1cP52432 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Polr1cP52432 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Polr1cP52432 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Polr1cP52432 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Polr1cP52432 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Polr1cP52432 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Polr1cP52432 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Polr1cP52432 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Polr1cP52432 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Polr1cP52432 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Polr1cP52432 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Polr1cP52432 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Polr1cP52432 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Polr1cP52432 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Polr1cP52432 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Polr1cP52432 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Polr1cP52432 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Polr1cP52432 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Polr1cP52432 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Polr1cP52432 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Polr1cP52432 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Polr1cP52432 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Polr1cP52432 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Polr1cP52432 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Polr1cP52432 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Polr1cP52432 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Polr1cP52432 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Polr1cP52432 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Polr1cP52432 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Polr1cP52432 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms