Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
FmodP50608 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
FmodP50608 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
FmodP50608 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
FmodP50608 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
FmodP50608 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
FmodP50608 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
FmodP50608 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
FmodP50608 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
FmodP50608 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
FmodP50608 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
FmodP50608 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
FmodP50608 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
FmodP50608 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
FmodP50608 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
FmodP50608 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
FmodP50608 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
FmodP50608 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
FmodP50608 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
FmodP50608 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
FmodP50608 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
FmodP50608 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
FmodP50608 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
FmodP50608 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
FmodP50608 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
FmodP50608 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
FmodP50608 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
FmodP50608 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
FmodP50608 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
FmodP50608 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
FmodP50608 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
FmodP50608 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
FmodP50608 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
FmodP50608 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
FmodP50608 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
FmodP50608 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
FmodP50608 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
FmodP50608 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
FmodP50608 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
FmodP50608 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
FmodP50608 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
FmodP50608 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
FmodP50608 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
FmodP50608 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
FmodP50608 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
FmodP50608 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
FmodP50608 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
FmodP50608 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
FmodP50608 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
FmodP50608 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
FmodP50608 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
FmodP50608 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
FmodP50608 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
FmodP50608 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
FmodP50608 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
FmodP50608 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
FmodP50608 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
FmodP50608 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
FmodP50608 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
FmodP50608 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
FmodP50608 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
FmodP50608 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
FmodP50608 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
FmodP50608 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
FmodP50608 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
FmodP50608 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
FmodP50608 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
FmodP50608 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
FmodP50608 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
FmodP50608 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
FmodP50608 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
FmodP50608 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
FmodP50608 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
FmodP50608 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
FmodP50608 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
FmodP50608 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
FmodP50608 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
FmodP50608 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
FmodP50608 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
FmodP50608 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
FmodP50608 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
FmodP50608 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
FmodP50608 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
FmodP50608 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
FmodP50608 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
FmodP50608 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
FmodP50608 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
FmodP50608 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
FmodP50608 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
FmodP50608 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
FmodP50608 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
FmodP50608 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
FmodP50608 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
FmodP50608 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
FmodP50608 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
FmodP50608 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
FmodP50608 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
FmodP50608 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
FmodP50608 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
FmodP50608 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms