Protein–RNA interactions for Protein: P50446

Krt6a, Keratin, type II cytoskeletal 6A, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt6aP50446 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt6aP50446 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt6aP50446 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt6aP50446 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt6aP50446 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt6aP50446 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt6aP50446 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt6aP50446 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt6aP50446 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt6aP50446 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt6aP50446 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt6aP50446 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt6aP50446 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt6aP50446 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt6aP50446 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt6aP50446 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt6aP50446 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt6aP50446 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt6aP50446 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt6aP50446 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt6aP50446 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt6aP50446 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt6aP50446 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt6aP50446 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt6aP50446 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt6aP50446 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt6aP50446 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt6aP50446 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt6aP50446 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt6aP50446 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt6aP50446 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt6aP50446 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt6aP50446 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt6aP50446 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt6aP50446 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt6aP50446 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt6aP50446 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt6aP50446 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt6aP50446 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt6aP50446 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt6aP50446 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt6aP50446 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt6aP50446 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt6aP50446 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt6aP50446 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt6aP50446 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt6aP50446 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt6aP50446 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt6aP50446 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt6aP50446 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt6aP50446 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt6aP50446 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt6aP50446 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt6aP50446 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt6aP50446 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt6aP50446 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt6aP50446 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt6aP50446 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt6aP50446 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt6aP50446 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt6aP50446 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt6aP50446 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt6aP50446 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt6aP50446 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt6aP50446 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt6aP50446 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt6aP50446 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt6aP50446 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt6aP50446 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt6aP50446 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt6aP50446 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt6aP50446 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt6aP50446 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt6aP50446 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt6aP50446 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt6aP50446 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt6aP50446 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt6aP50446 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt6aP50446 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt6aP50446 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt6aP50446 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt6aP50446 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt6aP50446 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt6aP50446 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt6aP50446 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt6aP50446 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt6aP50446 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt6aP50446 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt6aP50446 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt6aP50446 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt6aP50446 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt6aP50446 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt6aP50446 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt6aP50446 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt6aP50446 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt6aP50446 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt6aP50446 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt6aP50446 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt6aP50446 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt6aP50446 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms