Protein–RNA interactions for Protein: P50404

Sftpd, Pulmonary surfactant-associated protein D, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpdP50404 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SftpdP50404 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SftpdP50404 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SftpdP50404 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SftpdP50404 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SftpdP50404 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SftpdP50404 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SftpdP50404 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SftpdP50404 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SftpdP50404 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SftpdP50404 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SftpdP50404 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SftpdP50404 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SftpdP50404 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SftpdP50404 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SftpdP50404 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SftpdP50404 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SftpdP50404 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SftpdP50404 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SftpdP50404 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SftpdP50404 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SftpdP50404 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SftpdP50404 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SftpdP50404 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SftpdP50404 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SftpdP50404 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SftpdP50404 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SftpdP50404 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SftpdP50404 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SftpdP50404 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SftpdP50404 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SftpdP50404 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SftpdP50404 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SftpdP50404 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SftpdP50404 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SftpdP50404 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SftpdP50404 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SftpdP50404 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SftpdP50404 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SftpdP50404 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SftpdP50404 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SftpdP50404 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SftpdP50404 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SftpdP50404 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SftpdP50404 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SftpdP50404 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SftpdP50404 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SftpdP50404 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SftpdP50404 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SftpdP50404 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SftpdP50404 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SftpdP50404 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SftpdP50404 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SftpdP50404 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SftpdP50404 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SftpdP50404 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SftpdP50404 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SftpdP50404 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SftpdP50404 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SftpdP50404 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SftpdP50404 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SftpdP50404 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SftpdP50404 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SftpdP50404 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SftpdP50404 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SftpdP50404 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SftpdP50404 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SftpdP50404 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SftpdP50404 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SftpdP50404 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SftpdP50404 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SftpdP50404 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SftpdP50404 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SftpdP50404 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SftpdP50404 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SftpdP50404 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SftpdP50404 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SftpdP50404 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SftpdP50404 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SftpdP50404 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SftpdP50404 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SftpdP50404 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SftpdP50404 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SftpdP50404 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SftpdP50404 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SftpdP50404 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SftpdP50404 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SftpdP50404 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SftpdP50404 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SftpdP50404 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SftpdP50404 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SftpdP50404 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SftpdP50404 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SftpdP50404 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SftpdP50404 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SftpdP50404 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SftpdP50404 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SftpdP50404 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SftpdP50404 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SftpdP50404 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms