Protein–RNA interactions for Protein: P50136

Bckdha, 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit alpha, mitochondrial, mousemouse

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Length 442 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdhaP50136 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BckdhaP50136 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BckdhaP50136 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BckdhaP50136 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BckdhaP50136 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BckdhaP50136 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BckdhaP50136 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BckdhaP50136 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BckdhaP50136 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BckdhaP50136 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
BckdhaP50136 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BckdhaP50136 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BckdhaP50136 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BckdhaP50136 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
BckdhaP50136 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BckdhaP50136 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BckdhaP50136 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BckdhaP50136 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BckdhaP50136 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BckdhaP50136 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BckdhaP50136 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BckdhaP50136 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BckdhaP50136 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BckdhaP50136 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BckdhaP50136 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BckdhaP50136 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BckdhaP50136 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BckdhaP50136 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BckdhaP50136 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BckdhaP50136 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BckdhaP50136 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BckdhaP50136 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BckdhaP50136 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BckdhaP50136 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BckdhaP50136 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BckdhaP50136 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BckdhaP50136 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BckdhaP50136 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BckdhaP50136 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BckdhaP50136 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BckdhaP50136 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BckdhaP50136 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BckdhaP50136 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BckdhaP50136 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BckdhaP50136 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
BckdhaP50136 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BckdhaP50136 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BckdhaP50136 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BckdhaP50136 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BckdhaP50136 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BckdhaP50136 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BckdhaP50136 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BckdhaP50136 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BckdhaP50136 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BckdhaP50136 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BckdhaP50136 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BckdhaP50136 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BckdhaP50136 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BckdhaP50136 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BckdhaP50136 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BckdhaP50136 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BckdhaP50136 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BckdhaP50136 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BckdhaP50136 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BckdhaP50136 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BckdhaP50136 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BckdhaP50136 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BckdhaP50136 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BckdhaP50136 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BckdhaP50136 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BckdhaP50136 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BckdhaP50136 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BckdhaP50136 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BckdhaP50136 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BckdhaP50136 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BckdhaP50136 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BckdhaP50136 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
BckdhaP50136 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BckdhaP50136 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BckdhaP50136 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
BckdhaP50136 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BckdhaP50136 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BckdhaP50136 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BckdhaP50136 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BckdhaP50136 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BckdhaP50136 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BckdhaP50136 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BckdhaP50136 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BckdhaP50136 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BckdhaP50136 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BckdhaP50136 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BckdhaP50136 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BckdhaP50136 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BckdhaP50136 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BckdhaP50136 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BckdhaP50136 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BckdhaP50136 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BckdhaP50136 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BckdhaP50136 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BckdhaP50136 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms