Protein–RNA interactions for Protein: P47801

Emp1, Epithelial membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emp1P47801 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Emp1P47801 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Emp1P47801 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Emp1P47801 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Emp1P47801 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Emp1P47801 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Emp1P47801 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Emp1P47801 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Emp1P47801 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Emp1P47801 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Emp1P47801 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Emp1P47801 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Emp1P47801 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Emp1P47801 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Emp1P47801 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Emp1P47801 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Emp1P47801 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Emp1P47801 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Emp1P47801 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Emp1P47801 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Emp1P47801 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Emp1P47801 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Emp1P47801 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Emp1P47801 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Emp1P47801 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Emp1P47801 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Emp1P47801 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Emp1P47801 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Emp1P47801 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Emp1P47801 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Emp1P47801 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Emp1P47801 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Emp1P47801 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Emp1P47801 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Emp1P47801 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Emp1P47801 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Emp1P47801 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Emp1P47801 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Emp1P47801 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Emp1P47801 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Emp1P47801 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Emp1P47801 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Emp1P47801 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Emp1P47801 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Emp1P47801 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Emp1P47801 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Emp1P47801 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Emp1P47801 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Emp1P47801 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Emp1P47801 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Emp1P47801 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Emp1P47801 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Emp1P47801 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Emp1P47801 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Emp1P47801 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Emp1P47801 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Emp1P47801 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Emp1P47801 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.07■□□□□ 0
Emp1P47801 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Emp1P47801 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Emp1P47801 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Emp1P47801 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Emp1P47801 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Emp1P47801 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Emp1P47801 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Emp1P47801 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Emp1P47801 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Emp1P47801 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Emp1P47801 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Emp1P47801 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Emp1P47801 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Emp1P47801 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Emp1P47801 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Emp1P47801 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Emp1P47801 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Emp1P47801 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Emp1P47801 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Emp1P47801 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Emp1P47801 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Emp1P47801 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Emp1P47801 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Emp1P47801 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Emp1P47801 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Emp1P47801 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Emp1P47801 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Emp1P47801 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Emp1P47801 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Emp1P47801 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Emp1P47801 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Emp1P47801 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Emp1P47801 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Emp1P47801 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Emp1P47801 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Emp1P47801 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Emp1P47801 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Emp1P47801 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Emp1P47801 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Emp1P47801 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Emp1P47801 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Emp1P47801 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms