Protein–RNA interactions for Protein: P47774

Ccr7, C-C chemokine receptor type 7, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr7P47774 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccr7P47774 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccr7P47774 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccr7P47774 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccr7P47774 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccr7P47774 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccr7P47774 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccr7P47774 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccr7P47774 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccr7P47774 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccr7P47774 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccr7P47774 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccr7P47774 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccr7P47774 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccr7P47774 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccr7P47774 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccr7P47774 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccr7P47774 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccr7P47774 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccr7P47774 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccr7P47774 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccr7P47774 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccr7P47774 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccr7P47774 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccr7P47774 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccr7P47774 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccr7P47774 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccr7P47774 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccr7P47774 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccr7P47774 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccr7P47774 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccr7P47774 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccr7P47774 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccr7P47774 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccr7P47774 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccr7P47774 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccr7P47774 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccr7P47774 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccr7P47774 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccr7P47774 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccr7P47774 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccr7P47774 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccr7P47774 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccr7P47774 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccr7P47774 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccr7P47774 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccr7P47774 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccr7P47774 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccr7P47774 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccr7P47774 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccr7P47774 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccr7P47774 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccr7P47774 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccr7P47774 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccr7P47774 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccr7P47774 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccr7P47774 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccr7P47774 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccr7P47774 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccr7P47774 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccr7P47774 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccr7P47774 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccr7P47774 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccr7P47774 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccr7P47774 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccr7P47774 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccr7P47774 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccr7P47774 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccr7P47774 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccr7P47774 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccr7P47774 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccr7P47774 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccr7P47774 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccr7P47774 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccr7P47774 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccr7P47774 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccr7P47774 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccr7P47774 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccr7P47774 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccr7P47774 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccr7P47774 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccr7P47774 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccr7P47774 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccr7P47774 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccr7P47774 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccr7P47774 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccr7P47774 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccr7P47774 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccr7P47774 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccr7P47774 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccr7P47774 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccr7P47774 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccr7P47774 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccr7P47774 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccr7P47774 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccr7P47774 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccr7P47774 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccr7P47774 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccr7P47774 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccr7P47774 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms