Protein–RNA interactions for Protein: P46735

Myo1b, Unconventional myosin-Ib, mousemouse

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo1bP46735 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Myo1bP46735 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Myo1bP46735 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Myo1bP46735 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Myo1bP46735 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Myo1bP46735 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Myo1bP46735 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Myo1bP46735 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Myo1bP46735 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Myo1bP46735 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Myo1bP46735 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Myo1bP46735 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Myo1bP46735 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Myo1bP46735 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Myo1bP46735 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Myo1bP46735 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Myo1bP46735 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Myo1bP46735 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Myo1bP46735 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Myo1bP46735 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Myo1bP46735 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Myo1bP46735 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Myo1bP46735 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Myo1bP46735 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Myo1bP46735 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Myo1bP46735 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Myo1bP46735 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Myo1bP46735 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Myo1bP46735 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Myo1bP46735 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Myo1bP46735 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Myo1bP46735 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Myo1bP46735 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Myo1bP46735 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Myo1bP46735 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Myo1bP46735 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Myo1bP46735 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Myo1bP46735 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Myo1bP46735 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Myo1bP46735 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Myo1bP46735 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Myo1bP46735 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Myo1bP46735 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Myo1bP46735 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Myo1bP46735 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Myo1bP46735 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Myo1bP46735 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Myo1bP46735 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Myo1bP46735 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Myo1bP46735 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Myo1bP46735 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Myo1bP46735 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Myo1bP46735 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Myo1bP46735 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Myo1bP46735 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Myo1bP46735 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Myo1bP46735 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Myo1bP46735 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Myo1bP46735 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Myo1bP46735 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Myo1bP46735 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Myo1bP46735 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Myo1bP46735 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Myo1bP46735 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Myo1bP46735 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Myo1bP46735 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Myo1bP46735 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Myo1bP46735 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Myo1bP46735 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Myo1bP46735 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Myo1bP46735 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Myo1bP46735 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Myo1bP46735 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Myo1bP46735 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Myo1bP46735 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Myo1bP46735 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Myo1bP46735 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Myo1bP46735 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Myo1bP46735 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Myo1bP46735 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Myo1bP46735 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Myo1bP46735 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Myo1bP46735 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Myo1bP46735 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Myo1bP46735 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Myo1bP46735 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Myo1bP46735 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Myo1bP46735 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Myo1bP46735 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Myo1bP46735 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Myo1bP46735 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Myo1bP46735 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Myo1bP46735 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Myo1bP46735 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Myo1bP46735 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Myo1bP46735 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Myo1bP46735 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Myo1bP46735 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Myo1bP46735 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Myo1bP46735 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms