Protein–RNA interactions for Protein: P46660

Ina, Alpha-internexin, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
InaP46660 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
InaP46660 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
InaP46660 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
InaP46660 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
InaP46660 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
InaP46660 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
InaP46660 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
InaP46660 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
InaP46660 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
InaP46660 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
InaP46660 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
InaP46660 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.06■□□□□ 0
InaP46660 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
InaP46660 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
InaP46660 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
InaP46660 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
InaP46660 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
InaP46660 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
InaP46660 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
InaP46660 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
InaP46660 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
InaP46660 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
InaP46660 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
InaP46660 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
InaP46660 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
InaP46660 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
InaP46660 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
InaP46660 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
InaP46660 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
InaP46660 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
InaP46660 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
InaP46660 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
InaP46660 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
InaP46660 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
InaP46660 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
InaP46660 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
InaP46660 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
InaP46660 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
InaP46660 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
InaP46660 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
InaP46660 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
InaP46660 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.05■□□□□ -0
InaP46660 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
InaP46660 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
InaP46660 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
InaP46660 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
InaP46660 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
InaP46660 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
InaP46660 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
InaP46660 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
InaP46660 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
InaP46660 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
InaP46660 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
InaP46660 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
InaP46660 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
InaP46660 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
InaP46660 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
InaP46660 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
InaP46660 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
InaP46660 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
InaP46660 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
InaP46660 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
InaP46660 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
InaP46660 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
InaP46660 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
InaP46660 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
InaP46660 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
InaP46660 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
InaP46660 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
InaP46660 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
InaP46660 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.04■□□□□ -0
InaP46660 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
InaP46660 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
InaP46660 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
InaP46660 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
InaP46660 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.04■□□□□ -0
InaP46660 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.04■□□□□ -0
InaP46660 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
InaP46660 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
InaP46660 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.04■□□□□ -0
InaP46660 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
InaP46660 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
InaP46660 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
InaP46660 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
InaP46660 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
InaP46660 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
InaP46660 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
InaP46660 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
InaP46660 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
InaP46660 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
InaP46660 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
InaP46660 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
InaP46660 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
InaP46660 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
InaP46660 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
InaP46660 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
InaP46660 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
InaP46660 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
InaP46660 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
InaP46660 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms