Protein–RNA interactions for Protein: P46062

Sipa1, Signal-induced proliferation-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,037 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sipa1P46062 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sipa1P46062 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sipa1P46062 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sipa1P46062 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sipa1P46062 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sipa1P46062 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sipa1P46062 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sipa1P46062 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sipa1P46062 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sipa1P46062 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sipa1P46062 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sipa1P46062 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sipa1P46062 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sipa1P46062 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sipa1P46062 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sipa1P46062 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sipa1P46062 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sipa1P46062 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sipa1P46062 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sipa1P46062 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sipa1P46062 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sipa1P46062 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sipa1P46062 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sipa1P46062 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sipa1P46062 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sipa1P46062 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sipa1P46062 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sipa1P46062 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sipa1P46062 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sipa1P46062 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sipa1P46062 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sipa1P46062 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sipa1P46062 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sipa1P46062 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sipa1P46062 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sipa1P46062 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sipa1P46062 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sipa1P46062 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sipa1P46062 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sipa1P46062 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sipa1P46062 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sipa1P46062 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sipa1P46062 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sipa1P46062 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sipa1P46062 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sipa1P46062 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sipa1P46062 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sipa1P46062 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sipa1P46062 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sipa1P46062 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sipa1P46062 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sipa1P46062 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sipa1P46062 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sipa1P46062 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sipa1P46062 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sipa1P46062 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sipa1P46062 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sipa1P46062 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sipa1P46062 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sipa1P46062 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sipa1P46062 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sipa1P46062 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sipa1P46062 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sipa1P46062 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sipa1P46062 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sipa1P46062 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sipa1P46062 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sipa1P46062 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sipa1P46062 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sipa1P46062 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sipa1P46062 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sipa1P46062 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sipa1P46062 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sipa1P46062 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sipa1P46062 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sipa1P46062 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sipa1P46062 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sipa1P46062 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sipa1P46062 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sipa1P46062 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sipa1P46062 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sipa1P46062 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sipa1P46062 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sipa1P46062 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sipa1P46062 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sipa1P46062 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sipa1P46062 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sipa1P46062 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sipa1P46062 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sipa1P46062 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sipa1P46062 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sipa1P46062 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sipa1P46062 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sipa1P46062 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sipa1P46062 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sipa1P46062 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sipa1P46062 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sipa1P46062 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sipa1P46062 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sipa1P46062 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms