Protein–RNA interactions for Protein: P43247

Msh2, DNA mismatch repair protein Msh2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msh2P43247 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Msh2P43247 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Msh2P43247 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Msh2P43247 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Msh2P43247 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Msh2P43247 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Msh2P43247 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Msh2P43247 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Msh2P43247 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Msh2P43247 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Msh2P43247 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Msh2P43247 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Msh2P43247 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Msh2P43247 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Msh2P43247 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Msh2P43247 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Msh2P43247 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Msh2P43247 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Msh2P43247 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Msh2P43247 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Msh2P43247 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Msh2P43247 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Msh2P43247 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Msh2P43247 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Msh2P43247 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Msh2P43247 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Msh2P43247 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Msh2P43247 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Msh2P43247 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Msh2P43247 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Msh2P43247 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Msh2P43247 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Msh2P43247 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Msh2P43247 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Msh2P43247 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Msh2P43247 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Msh2P43247 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Msh2P43247 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Msh2P43247 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Msh2P43247 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Msh2P43247 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Msh2P43247 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Msh2P43247 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Msh2P43247 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Msh2P43247 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Msh2P43247 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Msh2P43247 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Msh2P43247 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Msh2P43247 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Msh2P43247 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Msh2P43247 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Msh2P43247 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Msh2P43247 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Msh2P43247 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Msh2P43247 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Msh2P43247 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Msh2P43247 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Msh2P43247 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Msh2P43247 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Msh2P43247 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Msh2P43247 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Msh2P43247 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Msh2P43247 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Msh2P43247 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Msh2P43247 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Msh2P43247 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Msh2P43247 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Msh2P43247 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Msh2P43247 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Msh2P43247 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Msh2P43247 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Msh2P43247 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Msh2P43247 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Msh2P43247 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Msh2P43247 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Msh2P43247 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Msh2P43247 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Msh2P43247 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Msh2P43247 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Msh2P43247 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Msh2P43247 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Msh2P43247 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Msh2P43247 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Msh2P43247 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Msh2P43247 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Msh2P43247 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Msh2P43247 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Msh2P43247 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Msh2P43247 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Msh2P43247 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Msh2P43247 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Msh2P43247 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Msh2P43247 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Msh2P43247 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Msh2P43247 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Msh2P43247 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Msh2P43247 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Msh2P43247 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Msh2P43247 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Msh2P43247 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms