Protein–RNA interactions for Protein: P43021

Nodal, Nodal, mousemouse

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Length 354 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NodalP43021 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NodalP43021 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NodalP43021 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
NodalP43021 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NodalP43021 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NodalP43021 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NodalP43021 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NodalP43021 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
NodalP43021 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NodalP43021 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NodalP43021 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NodalP43021 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NodalP43021 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NodalP43021 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NodalP43021 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NodalP43021 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NodalP43021 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NodalP43021 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NodalP43021 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NodalP43021 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NodalP43021 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NodalP43021 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NodalP43021 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NodalP43021 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NodalP43021 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NodalP43021 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NodalP43021 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NodalP43021 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NodalP43021 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NodalP43021 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NodalP43021 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NodalP43021 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
NodalP43021 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NodalP43021 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NodalP43021 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NodalP43021 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NodalP43021 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NodalP43021 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NodalP43021 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NodalP43021 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NodalP43021 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NodalP43021 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NodalP43021 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NodalP43021 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NodalP43021 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NodalP43021 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NodalP43021 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NodalP43021 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NodalP43021 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NodalP43021 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
NodalP43021 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NodalP43021 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NodalP43021 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NodalP43021 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NodalP43021 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NodalP43021 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NodalP43021 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NodalP43021 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NodalP43021 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NodalP43021 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NodalP43021 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NodalP43021 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NodalP43021 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NodalP43021 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NodalP43021 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NodalP43021 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NodalP43021 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NodalP43021 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NodalP43021 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NodalP43021 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NodalP43021 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NodalP43021 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NodalP43021 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NodalP43021 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NodalP43021 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NodalP43021 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NodalP43021 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NodalP43021 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NodalP43021 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NodalP43021 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NodalP43021 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NodalP43021 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NodalP43021 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NodalP43021 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NodalP43021 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NodalP43021 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NodalP43021 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NodalP43021 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NodalP43021 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NodalP43021 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
NodalP43021 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NodalP43021 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NodalP43021 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NodalP43021 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NodalP43021 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NodalP43021 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NodalP43021 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NodalP43021 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NodalP43021 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NodalP43021 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.9 ms